Akkor lehet hogy valami metadata kimaradt az exportálás során, ami a gopro kamerából kieső képeken még megvan 

Virtualdubbal próbáltad már?  
File / Open video file  < -- itt az első képet ki kell választani, a többit betölti automatikusan amíg növekvő a sorszám.

Ez után Video / Frame rate  és Video / Compression beállítása, majd File / Save as avi...